«1 октября произошли некоторые структурные изменения в госкорпорации "Ростех". Были введены должности так называемых индустриальных директоров, отвечающих за конкретные направления промышленного развития страны. Под "Ростехом" фактически сосредоточена все направление по созданию комплектующих для авиапрома, и это направление связано не только с авиапромом, но еще с "оборонкой", и космосом», — рассказал неназванный источник в авиационных кругах газете «Московский комсомолец».

Сначала индустриальным директором по авиационной промышленности назначили Алексея Федорова, но менее чем через месяц его заменили Сердюковым.

После отставки Сердюкова с поста министра обороны сообщалось, что он станет советником генерального директора «Ростехнологий» Сергея Чемезова. Однако пресс-служба корпорации опровергла эту информацию. В ноябре 2012 года Сердюков покинул пост главы наблюдательного совета компании. В ноябре 2013 года он стал гендиректором Федерального исследовательского центра машиностроения, который структурно входит в «Ростехнологии». 

Осенью 2012 года было возбуждено уголовное дело о махинациях в отношении имущества министерства обороны через компанию «Оборонсервис». Предварительный ущерб оценивался более чем в три миллиарда рублей. В ноябре 2012 года президент России Владимир Путин отправил Сердюкова в отставку из-за скандала. По делу «Оборонсервиса» Сердюков изначально проходил в качестве свидетеля. В ноябре 2013 года в отношении него возбудили уголовное дело о халатности, а в 2014 году экс-министр попал под амнистию. Дело в отношении него было целиком закрыто в июне 2014 года.