Сингапурские молекулярные биологи разработали метод анализа хроматина, который позволил подробно картировать белковые сети на концах хромосом и объяснить, как некоторые опухолевые клетки обходят естественный предел делений. Об этом пишет «Хайтек» со ссылкой на исследование, опубликованное в журнале Nature Communications.

Хроматин представляет собой форму упаковки генетического материала внутри клетки. Он регулирует работу генов и защищает ДНК от повреждений. За активацию и подавление отдельных участков генома отвечают белковые комплексы, однако существующие методы долгое время позволяли изучать лишь по одному белку одновременно. Из-за этого ученые не могли получить полную картину взаимодействий в конкретной области хромосомы.

Исследователи из Института онкологии Сингапура при Национальном университете Сингапура объединили иммунопреципитацию хроматина с количественной масс-спектрометрией и создали метод qChIP-MS. Он позволяет выделять нужные участки хромосом и одновременно определять состав всех связанных с ними белков, а также измерять их количество.

Читайте также
Ученые выяснили, после какого возраста резко снижаются шансы на успешные роды

Авторы также внедрили систему двойной химической фиксации. Она снижает вероятность попадания случайных молекул в результаты анализа и помогает избежать ложноположительных данных, которые долгое время оставались одной из проблем исследований в области эпигенетики.

Эффективность метода ученые проверили на теломерах — концевых участках хромосом, связанных с процессами клеточного старения. С помощью новой технологии они изучили белковую организацию механизма альтернативного удлинения теломер (ALT), который используют некоторые виды злокачественных опухолей, чтобы продолжать делиться без естественных ограничений.

По мнению исследователей, детальное картирование белковых сетей на таких теломерах может стать основой для разработки препаратов, способных нарушить работу механизма ALT и остановить размножение опухолевых клеток.